基于大脑不同区域的阿尔茨海默症基因表达数据分析

孔薇; 牟晓阳

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基于大脑不同区域的阿尔茨海默症基因表达数据分析

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提出了采用Tukey双权函数作为FastICA(Fast Independent Component Analysis)方法的非线性函数,对阿尔茨海默症(Alzheimer’s disease,AD)多个脑区域基因表达数据进行显著基因提取,揭示其基因表达调控关系.针对传统聚类方法基于全局聚类且只能将某个基因聚类到某一类的缺陷,改进的FastICA方法能够对基因表达数据进行快速有效的双向聚类,能够满足同一个基因可能参与不同信号传导通路的生物特性.同时考虑到人脑中海马区、内嗅皮质区、颞中回及视觉皮层区均与学习与记忆功能密切相关,将算法对多个脑区域进行基因表达调控综合分析.结果表明,大量炎症反应是AD致病的重要因素之一.

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来源
《上海交通大学学报》 |2013年第6期|994-997|共5页
作者
孔薇; 牟晓阳;
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作者单位

上海海事大学信息工程学院;

美国罗文大学医药研究中心;

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原文格式 PDF
正文语种 chi
中图分类基因理论;
关键词
微阵列基因表达数据; 阿尔茨海默症; 独立成分分析; 基因调控网络;

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