基于控制理论的关键基因预测算法

宋子健; 岳欣蕾; 李建伟

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针对目前关键基因预测不准确和预测算法缺乏等问题,本文提出一种基于控制理论的关键基因预测算法。首先,从TCGA数据库收集结直肠癌数据,使用计算机工具预处理数据,并利用结直肠癌数据和LncMAP数据库数据构建lncRNATF-gene调控网络。然后,设计一种新的筛选方法,基于控制理论中的最小驱动节点集思想和可控性动态分类理论,筛选得到关键节点基因集;将突变得分和网络拓扑分析方法得分融合分析,得到潜在关键基因集。最后,对关键节点基因集和潜在关键基因集取交集,得到关键基因集。结合相关文献和CGC数据库对关键基因集进行验证,证实了该预测算法的有效性,为预测结直肠癌关键基因提供了一种新的思路和方法。

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来源
《电脑知识与技术》 |2021年第30期|28-32|共5页
作者
宋子健; 岳欣蕾; 李建伟;
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作者单位

河北工业大学人工智能与数据科学学院;

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原文格式 PDF
正文语种 chi
中图分类自动控制理论;肿瘤病理学、病因学;
关键词
控制理论; 关键基因; 结直肠癌; 最小驱动节点集;

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