一种改进的多聚腺苷酸化位点提取方法

张洋子

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多聚腺苷酸化是真核生物基因表达的重要步骤。多聚腺苷酸化位点（Poly（A）位点）标识基因末端,准确识别poly（A）位点有利于确定成熟的m RNA。如果一个基因含有多个poly（A）位点,通过不同poly（A）位点的选择可以产生不同性质的m RNA（Alternative Polyadenylation,APA）。全基因组3’末端测序技术产生了大量包含poly（A）位点信息的序列,如何从这些序列中快速有效地获取poly（A）位点成为生物学家关注的焦点。本文针对3’末端测序数据,通过Perl脚本和生物信息软件的综合利用,设计了poly（A）位点的全基因组提取流程,可有效提取poly（A）位点并对其进行注释,该方法优势是适用于多种物种,适用性广,且运行高效。

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来源
《电脑知识与技术》 |2018年第19期|287+297-287+297|共1页
作者
张洋子;
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作者单位

厦门大学;

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原文格式 PDF
正文语种 chi
中图分类生物信息论;
关键词
Poly（A）位点; 3’末端测序技术; 提取流程;

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