青藏高原冰川棘豆适应性分子机制的转录组学初步研究

姬亚丽; 陈飞飞; 许国琪; 曹鹏熙; 李敬科; 刘星

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青藏高原冰川棘豆适应性分子机制的转录组学初步研究

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冰川棘豆(Oxytropis glacialis)是青藏高原特有种,具有很强的抗逆性,能在青藏高原多重胁迫条件下广泛分布,被认为是危害草原畜牧业生产最为严重的毒草。利用青藏高原不同生境条件下6个居群的17个冰川棘豆样本进行了转录组测序,结果显示:1)通过RNA-seq共得到956921788条Raw reads,质控后得到950938126条Clean reads,Q20(%)均大于98%,优化组装得到301738个unigenes,组装过滤后得到540308400条Clean reads,其中有338985738条比对到组装转录本上。2)unigenes的GO富集结果显示,富集程度较大的有细胞形状调节、高尔基囊泡介导的转运、色素的生物合成过程、脱落酸激活信号通路、肽基丝氨酸磷酸化与肽基丝氨酸修饰。KEGG富集表明,大部分unigenes被注释到光合作用、类胡萝卜素的生物合成、MAPK信号转导、植物激素信号转导以及植物与病原菌互作等相关通路。这些基因可能有利于冰川棘豆适应青藏高原低温、强辐射等极端环境,初步探究结果为进一步探讨其适应性分子机制和毒草防控提供了基础依据。

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来源
《环境生态学》 |2020年第4期|39-45|共7页
作者
姬亚丽; 陈飞飞; 许国琪; 曹鹏熙; 李敬科; 刘星;
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作者单位

西藏大学理学院西藏拉萨 850000;

武汉大学生命科学学院湖北武汉 430072;

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正文语种 chi
中图分类豆科;
关键词
青藏高原; 冰川棘豆; 转录组测序; 基因注释; 适应性;

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