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基于网络药理学和分子对接技术探讨凉膈散抑制急性肺损伤细胞因子风暴的机制

         

摘要

目的:利用网络药理学和分子对接技术,探讨凉膈散抑制急性肺损伤(acute lung injury,ALI)细胞因子风暴的作用机制.方法:从中药系统药理学数据库与分析平台中筛选凉膈散活性成分和作用靶点;通过人类孟德尔遗传综合数据库、Gene Cards等医学数据库获得ALI疾病靶点.利用Uniprot数据库查询靶点对应的基因,采用R软件及String数据库构建蛋白质-蛋白质相互作用(protein-protein Interaction,PPI)网络,运用Cytoscape软件构建"中药-化合物-靶点"相互作用网络,使用R软件进行基因本体(gene ontology,GO)功能富集分析、京都基因与基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)通路富集分析,预测其分子机制.将核心成分通过Autodock Vina软件与IL-1β、IL-6、TNF-α及糖原合成酶激酶3β受体进行分子对接.结果:凉膈散治疗ALI的活性成分149个、靶点237个,关键靶点涉及AKT1、IL-6及MAPK3等;GO功能富集以生物过程为主,包括氧化应激反应、脂多糖反应和细菌起源分子等.KEGG通路主要涉及PI3K-Akt、AGE-RAGE及TNF等通路;分子对接结果显示,连翘苷、豆甾醇、光甘草定、攀紫檀素及槲皮素等核心化合物的结合力与临床常用抗炎药相似,其中以连翘苷最强.结论:凉膈散可能通过连翘苷、槲皮素等多种活性成分作用于AKT1、IL-6、PI3K-Akt及AGE-RAGE等靶点与通路,从抗炎、抗菌、抗氧化和调节免疫方面发挥治疗ALI的作用.

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