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中华绒螯蟹一个种质鉴定相关RAPD标记的SCAR转化

         

摘要

通过克隆测序获取了中华绒螯蟹Opp17目的片段,分析其长度、碱基组成等序列特征.序列测定结果表明,克隆片段的准确大小为1170 bp,G+C含量为50.34%,Opp17 (TGACCCGCCT)引物与所测序列中的引物结合位点完全匹配.在GenBank中对序列进行BLast检索,未找到任何同源序列.在此基础上,在原有随机引物Opp17的基础上向3′端延伸13~19个nt以设计SCAR引物,最终设计了1对中华绒螯蟹特异性SCAR(sequence characterized ampLified regions,序列特征化扩增区)引物SCAR-1( F-TGACCCGCCTCAGCACCCGAACG; R-TGACCCGCCTCTCAGCCACACACC).利用这对引物对长江天然群体中华绒螯蟹基因组DNA进行PCR扩增,结果表明所有个体均能扩增出预期大小1170 bp的特异性条带.对目的条带进行回收测序,结果与之前的测序结果完全一致,表明本研究已成功获取了中华绒螯蟹种质鉴定国家标准中Oppl7目的条带的SCAR标记.

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