鳗鲡圆环病毒SYBR Green Ⅰ qPCR检测方法的建立与应用

林而舒

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为建立鳗鲡圆环病毒(Eel circovirus,EeCV)的SYBR GreenⅠ实时荧光定量PCR(qPCR)检测方法,根据EeCV复制相关蛋白(replication-associated protein,RAP)基因的保守序列设计特异性引物,并评价其灵敏性、特异性、重复性和应用效果。qPCR的阈值循环数(Cycle threshold value,C t值)与标准品的拷贝数线性关系良好,且线性范围广(1.0×108~102拷贝数/μL);可特异性检测EeCV,而对鳗鲡疱疹病毒(Anguillid herpesvirus)、猪圆环病毒(Porcine circovirus)、鸭圆环病毒(Duck circovirus)无扩增;重复性强,组内和组间变异系数均小于3%;灵敏性高于普通PCR法10倍。且qPCR检测后发现,在感染EeCV的鳗鲡体内重要器官均可检测到EeCV,其中鳃的病毒量显著高于其他组织;对保存的44份疑似鳗鲡病毒性感染病料进行检测,阳性检出率为98%,而普通PCR法的阳性检出率为73%。

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来源
《淡水渔业》 |2023年第3期|54-61|共8页
作者
林而舒;
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作者单位

福建省淡水水产研究所;

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原文格式 PDF
正文语种 chi
中图分类各种鱼的病害、敌害及其防治;
关键词
鳗鲡圆环病毒(Eel circovirus); 荧光定量PCR; SYBR GreenⅠ; 检测方法;

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