吉富罗非鱼肠道微生物群落初步研究

朱昊俊; 强俊; 陶易凡; 包景文; 陈德举; 徐跑

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吉富罗非鱼肠道微生物群落初步研究

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为研究人工饲养条件下吉富罗非鱼(Oreochromis niloticus)肠道微生物多样性及其群落结构组成.采用16S rDNA测序技术对罗非鱼肠道前段(IC1段)与后段(IC2段)微生物种群进行分析.结果显示:测序共计获得有效序列118490条,聚类为793个OTUs(Operational taxonomic units).在门水平上拟杆菌门(Bacteroidetes)、梭杆菌门(Fusobacteria)、变形菌门(Proteobacteria)、疣微菌门(Verrucomicrobia)、厚壁菌门(Firmicutes)和放线菌门(Ac-tinobacteria)六个门是优势菌门,占相对丰度的95％以上.差异分析表明,门水平上,IC1段和IC2段梭杆菌门和放线菌门相对丰度存在显著差异;属水平上,仅鲸杆菌属(Cetobacterium)存在显著差异.同时在多样性方面,IC1段的多样性要显著大于IC2段.结果表明吉富罗非鱼肠道不同分段菌群优势菌群的种类相对一致,但是相对丰度存在差异.

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来源
《淡水渔业》 |2020年第5期|88-93|共6页
作者
朱昊俊; 强俊; 陶易凡; 包景文; 陈德举; 徐跑;
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作者单位

南京农业大学无锡渔业学院江苏无锡214081;

中国水产科学研究院淡水渔业研究中心农业农村部淡水渔业和种质资源利用重点实验室江苏无锡214081;

南京农业大学无锡渔业学院江苏无锡214081;

南京农业大学无锡渔业学院江苏无锡214081;

南京农业大学无锡渔业学院江苏无锡214081;

南京农业大学无锡渔业学院江苏无锡214081;

中国水产科学研究院淡水渔业研究中心农业农村部淡水渔业和种质资源利用重点实验室江苏无锡214081;

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原文格式 PDF
正文语种 chi
中图分类罗非鱼（吴郭鱼）;
关键词
吉富罗非鱼(Oreochromis niloticus); 肠道菌群; 高通量测序技术; 多样性;

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