• 主题
高级搜索  >
历史搜索 清空历史
首页> 中文期刊> 《福建农业学报》 >香蕉GDSL脂肪酶基因家族全基因组鉴定与表达分析

香蕉GDSL脂肪酶基因家族全基因组鉴定与表达分析

         
页面导航
  • 摘要
  • 著录项
  • 相似文献
  • 相关主题

摘要

【目的】揭示香蕉GDSL脂肪酶基因家族(MaGDSL)序列特征及其在香蕉生长发育过程中的潜在功能。【方法】利用生物信息学方法对MaGDSL进行全基因组鉴定,分析其染色体、启动子顺式作用元件和转录因子结合位点(TFBS)的分布情况以及编码蛋白的理化性质、基因结构、保守基序和系统进化关系,并基于转录组数据库分析MaGDSLs在高温(45℃)/低温(4℃)处理的叶片、枯萎病菌FocTR4侵染的根系以及自然成熟/乙烯催熟的不同成熟阶段的果实中的表达模式,同时利用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)分析部分MaGDSL成员在花粉中的表达情况。【结果】香蕉A基因组中有76个MaGDSL成员,分布于11个染色体上,可分为9个亚家族,各成员编码区长度为1 014~2 193 bp,其中有5个成员含有不同数量的转录本;多数MaGDSL成员包含5个外显子和4个内含子,编码蛋白具有信号肽且主要定位在内外膜上;启动子区存在多种植物激素和逆境胁迫相关响应元件以及22种TFBSs;MaGDSLs中有3个串联重复基因簇位于4、8号染色体,6个串联重复基因对分别位于1、6、7、8、9和10号染色体上,22对片段重复基因分布在除11号染色体外的所有染色体上。MaGDSLs在香蕉叶片和根部的表达水平差异较大,且个别成员受高、低温胁迫以及枯萎病菌调控,其中5个成员(MaGDSL4-5、8-1、8-12、9-4、9-5)受高、低温胁迫抑制表达,而MaGDSL2-1和MaGDSL6-8受高、低温胁迫诱导表达,MaGDSL4-1和MaGDSL11-1受低温和FocTR4调控,MaGDSL5~8仅响应低温胁迫,其中MaGDSL2-2和MaGLP10-5对各种处理均有响应,而MaGDSL1-1在根系和花粉中均有高表达。【结论】MaGDSLs可能在香蕉生长发育过程中发挥重要作用,同时部分成员特异响应生物和非生物胁迫。

著录项

相似文献

  • 中文文献
  • 外文文献
  • 专利
获取原文

客服邮箱：kefu@zhangqiaokeyan.com

京公网安备：11010802029741号 ICP备案号：京ICP备15016152号-6 六维联合信息科技 (北京) 有限公司©版权所有

  • 客服微信

  • 服务号