2型糖尿病肝脏胰岛素抵抗差异基因分析

刘志红; 孟令振; 刘静; 鲁明; 王瑞英

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2型糖尿病肝脏胰岛素抵抗差异基因分析

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目的采用生物信息学的方法识别肝脏IR的关键基因,为改善2型糖尿病(T2DM)提供新思路。方法从CTD数据库下载IR相关基因,同时从GEO数据库下载T2DM基因表达谱GSE15653,利用GEO2R在线工具筛选出T2DM的差异表达基因(DEGs),取2个数据集的交集基因为肝脏胰岛素抵抗基因(IR-DEGs)。然后用R软件及STRING在线网站对IR-DEGs分别进行功能富集分析和蛋白质互作网络分析,并使用Cytoscape软件筛选关键基因。结果筛选得到1197个IR-DEGs,其中在GSE15653中上调IR-DEGs 352个,下调IR-DEGs 845个。基因本体分析提示IR-DEGs主要富集于类固醇激素反应、Hsp90蛋白结合、热休克蛋白绑定、转录辅助激活、多肽结合等。通路分析提示,IR-DEGs主要富集于磷酸戊糖途径、ErbB信号通路、MAPK信号通路、胰岛素信号通路等。利用Cytoscape筛选出10个关键基因,分别是MAPK3、SRC、MAPK8、CCNB1、DLGAP5、ASPM、KRAS、NRAS、NUSAP1、BIRC5。结论通过生物信息学分析可以发现肝脏胰岛素抵抗在2型糖尿病发展中起的新机制。

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来源
《河北医药》 |2022年第9期|1302-1306|共5页
作者
刘志红; 孟令振; 刘静; 鲁明; 王瑞英;
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作者单位

河北医科大学第二医院内分泌科;

河北医科大学第二医院医务处;

河北医科大学第四医院全科医学科;

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原文格式 PDF
正文语种 chi
中图分类糖尿病;
关键词
肝脏; 生物信息学分析; 胰岛素抵抗; 差异表达基因; GEO数据库;

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