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雷蒙德氏棉和亚洲棉基因组数据中LPAAT基因家族的发掘及其同源基因在陆地棉材料中的表达分析

         

摘要

溶血磷脂酸酰基转移酶(Lysophosphatidic acid acyltransferase,LPAAT)是油脂合成途径中的一个关键酶,能催化溶血磷脂酸转变为磷脂酸.本研究从雷蒙德氏棉(G.raimondii,D5)和亚洲棉(G.arboreum,A2)的基因组数据中得到17个LPAAT基因家族成员.利用生物信息学方法对二倍体棉花LPAAT基因进行基因结构、染色体分布以及系统进化分析.结果表明,LPAAT基因家族根据亲缘关系的远近可以分为不同的亚家族,各亚家族中LPAAT基因具有相似的基因结构;LPAAT家族基因编码的氨基酸序列具有3个保守基序,其中包括ΦFPEGTR-G结合位点和Φ-NHQS-ΦDΦΦ催化位点;通过对不同物种的LPAAT基因家族进行系统进化分析可知,不同物种中的LPAAT在进化中存在较大差异.基于陆地棉(G.hirsutum)不同发育时期的胚珠RNA-seq数据库和qRT-PCR表达分析,发现LPAAT基因可能对脂肪积累起到积极作用.本研究结果有助于了解棉属植物LPAAT基因家族的功能,以期从中选取较好的LPAAT基因进行进一步功能验证.

著录项

  • 来源
    《遗传》 |2015年第7期|692-701|共10页
  • 作者单位

    中国农业科学院棉花研究所,棉花生物学国家重点实验室,安阳455000;

    中国农业科学院棉花研究所,棉花生物学国家重点实验室,安阳455000;

    西北农林科技大学农学院,杨凌712100;

    中国农业科学院棉花研究所,棉花生物学国家重点实验室,安阳455000;

    中国农业科学院棉花研究所,棉花生物学国家重点实验室,安阳455000;

    中国农业科学院棉花研究所,棉花生物学国家重点实验室,安阳455000;

    中国农业科学院棉花研究所,棉花生物学国家重点实验室,安阳455000;

    中国农业科学院棉花研究所,棉花生物学国家重点实验室,安阳455000;

    中国农业科学院棉花研究所,棉花生物学国家重点实验室,安阳455000;

    西北农林科技大学农学院,杨凌712100;

    中国农业科学院棉花研究所,棉花生物学国家重点实验室,安阳455000;

  • 原文格式 PDF
  • 正文语种 chi
  • 中图分类
  • 关键词

    油脂; LPAAT家族; 基因结构; 系统进化分析; 表达分析;

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