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中国壮族和裕固族群体HLAⅠ类区域Alu插入多态性及其与HLA-A位点的相关性

         
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摘要

Many studies have show that the structurally polymorphic Alu insertion within HLA class I region are useful tools for investigating the origin, evolmion and recombination of HLA class Ⅰ progenitor haplotypes and gene diversity in different ethnic populations.In the present study, we determined the frequencies of HLA-Alus (i.e., AluMICB, AluTF,AluHJ, AluHG, and AluHF) in Zhuang and Yugu ethnic populations at first.Then combined with HLA genotyping data.we studied associations between HLA-Alus and HLA-A alleles in Zhuang, Yugu Bulang, Dai, and Hani ethnic populations.Our results showed that (l) the frequencies of five HLA-Alus were 1.5％～ 35.8％ and 9.2％～34.8％ in Zhuang and Yugu, respectively: and (2) the results of association between HLA-A alleles and HLA-Alu showed strong association between AluHG insalion and HLA-A *02 subtypes in all populations, association between AluHJ insertion and HLA-A *2402 in all populations, and association between AluHJ inseflion and HLA-A V/O/, -A *2407 in Bulang.The present study suggested that the distribution of HLA-Alus as well as the associations between HLA-Alus and HLA class I alleles are variable in different ethnic populations.HLA Alus alone or together with the HLA classⅠ alieles are informative genetic markers for the identification of HLA class I allele and variation of haplotype lineages in different populations.%近年来研究发现:位于HLAⅠ类基因区域的Alu插入是研究不同群体HLAⅠ类基因区域祖先单倍型和HLAⅠ类基因多样性产生、进化和重组的理想工具.文章对中国壮族和裕固族群体HLAⅠ类基因区域5个Alu插入多态性(AluMICB、AluTF、AluHJ、AluHG和AluHF)进行研究,结合HLA基因分型数据,分析壮族、裕固族、哈尼族、布朗族和傣族5个民族群体中Alu插入与HLA-A等位基因的关系.研究结果显示:(1)壮族和裕固族人群中5个Alu插入频率范围分别为1.5%～35.8%和9.2～34.8%,AluMICB、AluTF和Alu,HF插入频率在这两个群体中有统计学差异(P＜0.05);(2)在5个研究的群体中,AluHG插入与HLA-A*02的不同亚型关联;AluHJ插入与HLA-A*2402在5个群体中都关联,但AluHJ与HLA-A*1101和HLA-A*2407只在布朗族中关联.表明不同群体HLAⅠ类基因区域内Alu插入具有各自的特征,且Alu插入与不同的HJA-A等位基因相关联.这种Alu插入及其与HLA-A的关联特征可作为研究群体中HLAⅠ类基因和单倍型系谱变化的重要遗传标记.

著录项

  • 来源
    《遗传》 |2011年第2期|138-146|共9页
  • 作者

    史磊; 杨昭庆; 褚嘉祐; 姚宇峰; 史荔; 陶玉芬; 于亮; 黄小琴; 林克勤; 易文; 孙浩;

  • 作者单位

    中国医学科学院北京协和医学院医学生物学研究所遗传室,昆明,650118;

    中国医学科学院北京协和医学院医学生物学研究所遗传室,昆明,650118;

    中国医学科学院北京协和医学院医学生物学研究所遗传室,昆明,650118;

    中国医学科学院北京协和医学院医学生物学研究所遗传室,昆明,650118;

    中国医学科学院北京协和医学院医学生物学研究所遗传室,昆明,650118;

    中国医学科学院北京协和医学院医学生物学研究所遗传室,昆明,650118;

    中国医学科学院北京协和医学院医学生物学研究所遗传室,昆明,650118;

    中国医学科学院北京协和医学院医学生物学研究所遗传室,昆明,650118;

    中国医学科学院北京协和医学院医学生物学研究所遗传室,昆明,650118;

    中国医学科学院北京协和医学院医学生物学研究所遗传室,昆明,650118;

    中国医学科学院北京协和医学院医学生物学研究所遗传室,昆明,650118;

  • 原文格式 PDF
  • 正文语种 chi
  • 中图分类
  • 关键词

    HLAⅠ类基因; Alu插入; 祖先单倍型;

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