基于多尺度熵的DNA序列相似性分析

张静; 周小安; 赵宇

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基于多尺度熵的DNA序列相似性分析

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DNA序列的相似性分析已成为当前生物信息学科中的研究热点,对分析算法的需求也逐步增加,基于样本熵的DNA序列相似性分析方法存在一定的效率问题。本文提出了一种基于多尺度熵的分析方法,以7种病毒DNA序列作为实验研究的对象,采用整数法将其分别表示为时间序列,而后通过对比多个时间尺度下序列之间样本熵互值大小来显示序列之间的相关性,并与原有的样本熵算法的分析结果进行比较。实验表明,本文提出多尺度熵分析方法是切实可行的。

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来源
《智能计算机与应用》 |2019年第1期|P.19-23|共5页
作者
张静; 周小安; 赵宇;
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作者单位

[1]深圳大学信息工程学院;

广东深圳518000;

[1]深圳大学信息工程学院;

广东深圳518000;

[1]深圳大学信息工程学院;

广东深圳518000;

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原文格式 PDF
正文语种 CHI
中图分类生物信息论;
关键词
相似性分析; DNA序列; 样本熵; 多尺度熵;

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