中国南阳黄牛HDAC1基因SNP检测及与生长性状的相关性分析

杨颖; 陆江; 李湘萍; 佘纳; 唐核心; 石德顺; 吕祁峰; 徐照学

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采用DNA测序比对和PCR-SSCP分析技术,以15头南阳黄牛为样本,探讨HDAC1基因第5外显子、第11外显子、3′-UTR序列的单核苷酸多态性以及与南阳黄牛经济性状的关联性.结果显示,南阳黄牛HDAC1基因纯合子TT型频率比例最小,纯合子CC型频率比例最大;C等位基因占多数.南阳黄牛HDAC1基因第5外显子没有多态性位点;第11外显子在第110 bp处存在A/G突变位点,为同义突变.南阳黄牛HDAC1基因mRNA 3′-UTR非翻译区存在2个突变:199 bp处的T/C多态性位点,其中TT型基因型频率>TG型;以及49 bp处的A/C多态性位点,其中AA型基因型频率>AC型.南阳黄牛HDAC1基因第11外显子基因多态性位点与其生长性状关联分析显示:AG和AA基因型群体中腰角宽、体长有显著性差异(P<0.05),GG基因型比AG基因型群体在日增质量水平有显著提高(P<0.05);在腰角宽、体长、日增质量上加性效应及显性效应水平显著(P<0.05);其余性状均值在不同基因型群体中差异不显著.南阳黄牛HDAC1基因mRNA 3′-UTR非翻译区T/C(199 bp)处位点多态性与生长性状关联性分析发现,各性状在不同基因型群体的均值均无显著差异;A/G(49 bp)处位点多态性与其生长性状关联分析表明:AC和AA基因型群体中在体高、尻长、十字部高和日增质量经济性状上差异显著(P<0.05),体长性状二者差异极显著(P<0.01).研究结果证实了南阳黄牛经济性状与其HDAC1基因片段中的一些SNP位点差异或多态性有关,这些SNP位点可以考虑为潜在的南阳黄牛分子育种目标位点.

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来源
《江苏农业科学》 |2018年第16期|25-30|共6页
作者
杨颖; 陆江; 李湘萍; 佘纳; 唐核心; 石德顺; 吕祁峰; 徐照学;
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作者单位

广西大学动物科学技术学院;

广西南宁 530004;

上海交通大学附属上海市第九人民医院;

上海200002;

湖北医药学院麻醉学研究所及附属太和医院麻醉科;

湖北十堰442000;

广西大学动物科学技术学院;

广西南宁 530004;

湖北医药学院麻醉学研究所及附属太和医院麻醉科;

湖北十堰442000;

湖北医药学院麻醉学研究所及附属太和医院麻醉科;

湖北十堰442000;

广西大学动物科学技术学院;

广西南宁 530004;

上海交通大学附属上海市第九人民医院;

上海200002;

河南省畜牧研究所;

河南郑州476800;

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原文格式 PDF
正文语种 chi
中图分类遗传;
关键词
南阳黄牛; HDAC1基因; 单核苷酸多态性; 生长性状;

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