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禾谷镰刀菌甾醇14α脱甲基酶基因cDNA克隆及生物信息学分析

         

摘要

克隆获得禾谷镰刀菌(Fusarium graminearum)2个甾醇14α脱甲基酶 CYP51蛋白(CYP51A、CYP51B)基因cDNA 序列,明确其氨基酸序列典型特征,为研究蛋白质结构及其抗药性机制奠定基础。采用 RT -PCR 技术,克隆2个 CYP51蛋白基因 cDNA 序列,利用相关生物信息软件对其序列进行生物信息学分析。结果克隆到2条 cDNA 序列,长度分别为1524、1581 bp,分别编码507、526个氨基酸;2个蛋白分子量分别为57.5、59.3 ku,等电点分别为6.93、7.08,不稳定系数分别为49.43、39.05;2个蛋白均含有细胞色素 P450家族成员典型的保守结构域;不具有信号肽的属于非分泌性蛋白,具有跨膜结构域,是亲水性蛋白;蛋白质二级结构最主要的结构元件是α螺旋、无规则卷曲,并散布于整个蛋白中;亚细胞定位预测显示,CYP51A 蛋白主要位于内质网及高尔基体等细胞器中,而 CYP51B 主要位于细胞质中。研究结果将为进一步研究 CYP51蛋白生物学功能及其蛋白结构生物学提供参考。

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