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甘蓝冷胁迫相关基因BobHLH18克隆与表达分析

         
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摘要

利用同源克隆方法在耐寒,迟抽薹甘蓝自交系Y923中克隆到一个甘蓝响应冷胁迫bHLH转录因子基因BobHLH18的DNA和cDNA全长,基因组搜索分析结果表明,该基因位于甘蓝1号染色体上,属于LF1亚基因组编码基因;序列分析结果表明,该基因含有4个外显子和3个内含子,编码338个氨基酸,蛋白质分子量为38380,等电点为6.80,其编码蛋白质的N端含有一个bHLH结构域;亚细胞定位分析指出该基因编码蛋白质定位在细胞核上,表明该基因编码蛋白质为核定位蛋白质,与其为转录因子特征相符;序列比对结果显示,BobHLH18蛋白与白菜和拟南芥中的bHLH蛋白具有较高的同源性,相似度分别为90.5％和89.0％;聚类分析指出BobHLH18及其同源蛋白分别聚类成2个进化分支,且来自十字花科植物的bHLH18同源蛋白质都聚在同一进化分支上;qRT-PCR分析结果表明BobHLH18基因受冷胁迫诱导,能在叶片中被较高的诱导表达,表明该基因可能在甘蓝叶片应答冷胁迫过程中起重要作用.

著录项

  • 来源
    《江苏农业学报》 |2019年第1期|149-156|共8页
  • 作者

    秦文斌; 戴忠良; 山溪; 唐君; 王神云; 李建斌;

  • 作者单位

    江苏丘陵地区镇江农业科学研究所;

    江苏 句容 212400;

    江苏丘陵地区镇江农业科学研究所;

    江苏 句容 212400;

    江苏丘陵地区镇江农业科学研究所;

    江苏 句容 212400;

    江苏省高效园艺作物遗传改良重点实验室/ 江苏省农业科学院蔬菜研究所;

    江苏 南京 210014;

    江苏省高效园艺作物遗传改良重点实验室/ 江苏省农业科学院蔬菜研究所;

    江苏 南京 210014;

    江苏省高效园艺作物遗传改良重点实验室/ 江苏省农业科学院蔬菜研究所;

    江苏 南京 210014;

  • 原文格式 PDF
  • 正文语种 chi
  • 中图分类 甘蓝类;
  • 关键词

    甘蓝; BobHLH18; 转录因子; 冷胁迫;

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