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首页> 中文期刊> 《农业生物技术学报》 >嗜水气单胞菌感染后唇䱻的转录组测序及相关免疫基因分析

嗜水气单胞菌感染后唇䱻的转录组测序及相关免疫基因分析

         
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摘要

细菌性肠炎在水产养殖过程中频繁发生,然而细菌性肠炎的确切机制尚不十分清楚。本研究旨在鉴定与嗜水气单胞菌(Aeromonas hydrophila)感染诱导的肠炎相关的新候选基因,以嗜水气单胞菌感染唇䱻(Hemibarbus labeo)为材料,利用BGISEQ-500平台,对其肠道进行转录组测序。结果显示,测序共获得120173个unigene,平均长度为1328 bp,组装质量指标N50为2647 bp,其中72.71%为已知基因。差异表达基因筛选发现,嗜水气单胞菌感染后共有33706个基因显著差异表达,其中18878个基因上调,14828个基因下调。通过GO富集分析发现,差异表达基因主要富集于细胞过程、代谢进程、生物调控、细胞、细胞组分和结合等。通过KEGG富集分析发现,差异表达基因主要富集于信号转导、免疫系统、癌症和传染病等信号通路。差异表达基因分析和qPCR验证显示,抗菌肽基因铁调素(hepcidin)、肝表达抗菌肽2(liver-expressed antimicrobial peptide 2,leap2)和炎症细胞因子基因白细胞介素1β(interleukin-1β,IL-1β)、肿瘤坏死因子-α(tumor necrosis factor-α,TNF-α)、IL6和IL8的表达在嗜水气单胞菌感染后显著上调。化学合成Hepcidin、LEAP2和细胞溶素(NK-lysin)并检测了其对嗜水气单胞菌的抗菌活性,发现Hepcidin和LEAP2可以有效抑制嗜水气单胞菌的繁殖。本研究为进一步了解唇䱻和其他养殖鱼类细菌性肠炎的致病机制提供了基础数据。

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