利用目标起始密码子多态性(SCoT)分子标记分析梨遗传多样性

杨君祎; 徐超; 杨芳梅; 方志; 闫冲冲; 张金云; 蔡永萍; 林毅

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目标起始密码子多态性(start codon targeted polymorphism,SCoT)是一种新型的遗传分子标记技术.本研究采用单因素水平设计方法,优化并建立梨的适宜SCoT分子标记体系,通过SCoT标记技术,分析了安徽省砀山县的43份梨(Pyrus spp.)的遗传多样性和亲缘关系.结果表明,优化后梨SCoT-PCR反应体系:10×Easy Taq Buffer(含2 mmol/L Mg2+)2.5 μL,模板DNA终浓度30 mg/L,上下游引物终浓度1.0 μmol/L,dNTPs终浓度0.2 mmol/L,Taq DNA聚合酶1.0U,总体积为25 μL.随机选取2个DNA模板进行引物筛选,最终从67条引物中筛选出16条扩增条带清晰且有差异性的引物,共扩增出145条带,其中多态性条带有126条,多态性比率为86.1％,每条引物平均扩增出9.1条带.SCoT标记的43个梨材料遗传相似性系数为0.517～0.931,平均值为0.685.聚类分析表明,在遗传相似系数为0.610的水平上,43份梨材料分为A和B两组;在遗传相似系数为0.746的水平上,A组又分为6个亚组(Ⅰ～Ⅵ).所研究的43份梨材料具有丰富的遗传多样性,且能够被SCoT分子标记有效地检验,为进一步研究利用安徽省砀山县梨种质资源提供了依据.

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来源
《农业生物技术学报》 |2015年第5期|588-597|共10页
作者
杨君祎; 徐超; 杨芳梅; 方志; 闫冲冲; 张金云; 蔡永萍; 林毅;
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作者单位

安徽农业大学生命科学学院,合肥230036;

安徽农业大学生命科学学院,合肥230036;

安徽农业大学生命科学学院,合肥230036;

安徽农业大学生命科学学院,合肥230036;

安徽农业大学生命科学学院,合肥230036;

安徽省农业科学院园艺研究所,合肥230031;

安徽农业大学生命科学学院,合肥230036;

安徽农业大学生命科学学院,合肥230036;

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正文语种 chi
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关键词
梨; 目标起始密码子多态性(SCoT); 遗传多样性; 聚类分析;

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