凹大叶蝉线粒体全基因组序列分析及系统发育关系

俞鹏飞; 李倩; 王梦馨; 潘铖; 崔林; 韩宝瑜

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凹大叶蝉线粒体全基因组序列分析及系统发育关系

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凹大叶蝉(Bothrogonia ferruginea)是我国一类重要的农业经济害虫,测序和分析凹大叶蝉线粒体基因组,并在线粒体水平上探讨凹大叶蝉在头喙亚目中的系统发育地位,对凹大叶蝉系统分类研究具有重要的意义.本研究采用PCR扩增与克隆测序技术,拼接获得凹大叶蝉线粒体基因组全序列,基于蛋白质编码基因的串联序列构建系统发育树.凹大叶蝉线粒体基因组全长15 262 bp (GenBank No.KU167550),包括13个蛋白编码基因(protein-coding genes,PCGs),22个tRNA基因,2个rRNA基因和一段A+T富集区,呈现出与头喙亚目昆虫一致的核苷酸组成和基因排布顺序.基因组碱基A+T含量为76.48％,AT偏度率为0.170 2.基因重叠区域共计14处,基因间隔区域共计10处.A+T富含区内存在ATTTA碱基序列并在其后存在一个典型的微卫星结构(TA)25.叶蝉科昆虫A+T富集区的串联重复区被发现存在ATCTA和CCCTCT两段特殊结构,而角蝉科和其他头喙亚目昆虫未发现此特殊结构.头喙亚目22个种基于线粒体基因组的系统发育关系发现为沫蝉总科+(蜡蝉总科+角蝉总科),凹大叶蝉与檬果褐叶蝉(Idioscopus nitidulus)等4种叶蝉归属于头喙亚目角蝉总科叶蝉科.凹大叶蝉线粒体基因组的基因排布与叶蝉科其他昆虫完全相同,基于线粒体基因组的头喙亚目系统发育关系与传统形态学研究结果一致:凹大叶蝉归属于头喙亚目角蝉总科叶蝉科.本研究为头喙亚目系统分类的深入研究提供了数据资料.

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来源
《农业生物技术学报》 |2019年第7期|1246-1258|共13页
作者
俞鹏飞; 李倩; 王梦馨; 潘铖; 崔林; 韩宝瑜;
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作者单位

中国计量大学浙江省生物计量及检验检疫技术重点实验室;

杭州310018;

中国计量大学浙江省生物计量及检验检疫技术重点实验室;

杭州310018;

中国计量大学浙江省生物计量及检验检疫技术重点实验室;

杭州310018;

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杭州310018;

中国计量大学浙江省生物计量及检验检疫技术重点实验室;

杭州310018;

中国计量大学浙江省生物计量及检验检疫技术重点实验室;

杭州310018;

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原文格式 PDF
正文语种 chi
中图分类植物虫害及其防治;
关键词
凹大叶蝉; 叶蝉科; 线粒体基因组; 头喙亚目; 系统发育;

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