基于基因组微卫星的团头鲂养殖群体遗传多样性分析和指纹图谱构建

张芹; 王延晖; 王冰柯; 屈长义; 刘英杰

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基于基因组微卫星的团头鲂养殖群体遗传多样性分析和指纹图谱构建

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利用基因组微卫星检测2个团头鲂(Megalobrama amblycephala)养殖群体的遗传多样性,18个位点共检测到126个等位基因,大小在135~362 bp。各位点观测等位基因数(N_(a))在3~15个,平均为7个;有效等位基因数(N_e)在1.250~6.979,平均为3.603。各位点检测到的香农信息指数(I)在0.417~2.213,平均为1.384。观测杂合度(H_o)在0.219~0.856,平均值为0.647;期望杂合度(H_e)在0.200~0.857,平均值为0.665。多态信息含量指数(PIC)在0.190~0.843,平均值为0.624。群体间的遗传分化指数(F_(st))为0.070,群体间的基因交流(N_(m))为1.59,说明HH和YH 2个群体之间有一定程度基因流。2个位点检测到的近交系数(F_(is))>0,其他16个位点近交系数均<0。研究表明,HH和YH两个人工养殖群体中均有较高的遗传多样性,群体间有一定程度的基因交流,指纹图谱的构建可以用来进行团头鲂种质资源品种间的鉴定以及品种内的亲缘关系研究,尤其是可以区分没有亲缘关系数据背景的群体,可以指导没有家系构建能力的苗种繁育场进行繁殖策略的升级。

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来源
《安徽农业科学》 |2023年第8期|99-104|共6页
作者
张芹; 王延晖; 王冰柯; 屈长义; 刘英杰;
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作者单位

河南省水产科学研究院;

商丘市水产技术推广站;

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原文格式 PDF
正文语种 chi
中图分类水产生物学;
关键词
团头鲂; 基因组; SSR; 多态性;

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