广东烟区育种材料遗传性状及群体结构分析

宗钊辉; 陈帧禄; 贺广生; 王军; 曾涛; 陈泽鹏; 赵伟才

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广东烟区育种材料遗传性状及群体结构分析

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为明确广东烟草主要育种材料间的遗传关系,通过对广东烟草的5个主要育种材料(YY98、HY1、NX002、NX212与K326)重测序,进行遗传多样性及群体结构分析。平均测序深度高达25.10X,R_q30>95%,基因组平均覆盖度为92.88%,通过筛选分析,最终获得26728180 SNPs,不同染色体间SNP数量分布差异较大,SNP密度在7.4~11.1个/kb,其中17号染色体上数量最多。不同品种间在Chr3、Chr4、Chr8、Chr12、Chr14和Chr22上分化程度较大,其中Chr3染色体分化程度最大,平均杂合度为0.4715。K326、NX002、NX212群体的杂合度大于0.5000,具备较高的遗传多样性。系统发育树与主成分分析均认为NX002与K326,HY1与YY98亲缘关系接近,聚为一类,NX212单独分支。该研究为广东烟草亲本选配、优良育种材料利用提供技术支持。

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来源
《安徽农业科学》 |2023年第19期|31-35|共6页
作者
宗钊辉; 陈帧禄; 贺广生; 王军; 曾涛; 陈泽鹏; 赵伟才;
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作者单位

广东省烟草科学研究所;

广东烟草韶关市有限公司;

中国烟草总公司广东省公司;

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正文语种 chi
中图分类烟草（菸草）;
关键词
烟草品种; 重测序; SNP; 群体分析; 多样性分析;

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