双歧杆菌BB12菌株Sec分泌途径及底物蛋白分析

岳旭升; 暮雪; 张百惠; 吴天; 张路路; 朱德全

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双歧杆菌BB12菌株Sec分泌途径及底物蛋白分析

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cqvip:[目的]采用生物信息学方法分析双歧杆菌BB12菌株的Sec途径分泌系统及预测底物蛋白。[方法]以双歧杆菌BB12菌株基因组注释的蛋白氨基酸序列为研究对象,在NCBI中以Fasta形式下载,采用一系列生物信息学软件分析该基因组中Sec分泌途径及底物蛋白行使的功能,同时采用COG功能数据库对这些蛋白进行功能注释和聚类分析。[结果]通过分析发现双歧杆菌BB12菌株Sec分泌途径相关的蛋白基因共有9个,其中5个是Sec分泌途径构建蛋白基因,2个信号肽酶识别基因,1个脂蛋白信号肽识别基因和1个信号肽识别蛋白编码基因。Sec底物蛋白分析发现该菌共含1583个蛋白,经过Sec分泌途径到细胞外的蛋白有57个,35个具有COG功能,占61%,其中被SpaseI型信号肽酶识别的有37个,被SpaseⅡ型信号肽酶识别的有20个。[结论]COG功能注释显示一些蛋白没有功能,有功能的蛋白主要与氨基酸运输和代谢、碳水化合物的运输和代谢、功能细胞壁/膜和无机离子运输和代谢功能有关。

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来源
《安徽农业科学》 |2019年第19期|175-177|共3页
作者
岳旭升; 暮雪; 张百惠; 吴天; 张路路; 朱德全;
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作者单位

佳木斯大学理学院黑龙江佳木斯154007;

佳木斯大学生命科学学院黑龙江佳木斯154007;

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正文语种 chi
中图分类基础科学;
关键词
双歧杆菌BB12; 基因组; 分泌蛋白; 功能分析;

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