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核酸染色剂对DNA在琼脂糖凝胶电泳中迁移速度的影响

         

摘要

cqvip:核酸染色应用在许多DNA检测相关的技术领域,然而染色剂结合DNA会造成电泳迟滞。为研究溴化乙锭(ethidium bromide,EB)和GelRed这2种核酸染色剂对DNA在琼脂糖凝胶电泳中迁移速度的影响,分别用这2种染色剂采用前、后染色的方法对DNA进行染色,以琼脂糖凝胶电泳作为检测方法,凝胶成像系统拍照观察,用Reptation理论分析数据。研究结果表明EB和GelRed染色均使DNA迁移发生了滞后,但EB对于目的基因片段大小的判读未受电泳滞后的影响,而GelRed对目的基因判读略有影响。然而,与EB相比,GelRed具有荧光效果强、安全、环保等诸多优点。总之,需要精确鉴定目的基因片段大小可以选择后染色或EB前染色,对于鉴定目的基因片段大小要求不高且需要荧光效果好、环保的染色剂可以选择GelRed。

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