'三台'核桃不同成熟期果实转录组分析

贺娜; 耿树香; 宁德鲁; 肖良俊

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'三台'核桃不同成熟期果实转录组分析

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以云南优良品种"三台"核桃4个不同成熟期种仁为材料,从分子水平上探索云南核桃(Juglans sigillata)种子不同成熟期种仁合成相关基因的表达模式.共有53868条unigenes得到了注释,其中33407条unigenes注释在Nr数据库中;31725条unigenes注释在KEGG数据库中;Swissprot数据库中注释到19842条unigenes;COG数据库中注释到16655条unigenes.四大数据库共注释到33753条unigenes,占总unigenes的62.66％.CK-vs-HT1、CK-vs-HT2、CK-vs-HT3、HT1-vs-HT2、HT1-vs-HT3、HT2-vs-HT3分别有2417、2703、4166、1256、5347、3283条上调表达的差异基因和9515、12455、9498、1751、3132、1365条下调表达的差异基因.不同时期基因差异表达富集度最高的为脂肪酸生物合成代谢通路.核桃果实在成熟中后期,油脂及蛋白大量积累,相关基因表达量增加.

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来源
《安徽农业科学》 |2020年第23期|165-169178|共6页
作者
贺娜; 耿树香; 宁德鲁; 肖良俊;
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作者单位

云南省林业和草原科学院云南昆明650201;

云南省林业和草原科学院云南昆明650201;

云南省林业和草原科学院云南昆明650201;

云南省林业和草原科学院云南昆明650201;

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原文格式 PDF
正文语种 chi
中图分类核桃（胡桃）;
关键词
"三台"核桃; 成熟度; 转录组; 基因;

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