基于药物重定位策略预测治疗多发性骨髓瘤的候选化合物

邹敏; 李锐峰; 陈岷; 颜晓燕; 史惠卿

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基于药物重定位策略预测治疗多发性骨髓瘤的候选化合物

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采用药物重定位(Drug repositioning,DR)策略预测多发性骨髓瘤的候选化合物,为多发性骨髓瘤的治疗提供新的思路和方向.利用GEO数据库检索并筛选多发性骨髓瘤表达谱芯片数据,GEO2R软件提取差异表达基因(DEGs);DAVID和Panther数据库对差异表达基因进行富集和通路分析;利用STRING数据库构建蛋白-蛋白相互作用网络分析;将差异表达基因导入CMAP连接图,计算获得治疗MM的候选化合物,进一步对候选化合物进行查找和分析.结果显示:共获得差异表达基因53个,包括上调差异表达基因10个、下调差异表达基因43个;GO分析结果表明生物学过程涉及22个功能簇,分子功能涉及5个功能簇,细胞成分涉及5个功能簇;KEGG分析涉及10条通路;蛋白-蛋白相互作用网络分析显示VCAM1、CCR2、CCL3和CXCL12等4个基因为富集程度最高的核心差异表达基因;通过CMAP连接图计算得到排名前20的候选化合物,其中LY-294002和Tanespimycin可能对MM有潜在治疗作用,但还有待深入试验研究和临床验证.

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来源
《生物学杂志》 |2021年第1期|23-28|共6页
作者
邹敏; 李锐峰; 陈岷; 颜晓燕; 史惠卿;
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作者单位

成都医学院药学院成都610500;

成都医学院药学院成都610500;

四川省医学科学院四川省人民医院药学部成都610072;

成都医学院药学院成都610500;

中国人民解放军西部战区总医院成都610083;

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原文格式 PDF
正文语种 chi
中图分类抗肿瘤、抗癌药物;骨髓肿瘤;
关键词
药物重定位; 多发性骨髓瘤; 差异表达基因; 候选化合物; 生物信息学;

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