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基于遗传算法与星比对的多序列比对混合算法

         

摘要

多序列比对(MSA)是一个典型的NP完全问题,星比对是一种有效的多序列比对算法.文章针对MSA问题提出了将遗传算法与星比对算法结合在一起的混合算法,该算法充分发挥了遗传算法和星比对算法的优越性,可提高求解MSA问题的计算精度和计算速度 ,整个算法模拟了自然界进化的周期性,较好的解决了群体的多样性和收敛深度的矛盾.实验表明,该算法是有效的.

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