罗非鱼海豚链球菌16S rRNA基因的序列测定和系统进化分析

甘西; 陈明; 余晓丽; 李莉萍; 陈汉忠; 徐增辉; 雷爱莹; 梁万文; 黄维义

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为了从分子水平上对1株致病性罗非鱼链球菌进行分类学鉴定,利用原核生物16S rRNA基因通用引物对分离纯化的罗非鱼致病性链球菌进行16S rRNA基因的克隆及序列分析.结果扩增出长约1.5 kp目的片段,测序得到1条长度为1 447 bp核苷酸序列.核苷酸相似性分析表明,序列与NCBI公布的海豚链球菌(Streptococcus iniae,S.iniae)SCCF5L菌株16S rRNA基因核苷酸序列相似性最高(99.4%),暂称为中国广西株(S.iniae-CGX).同时,亲源关系较近的S.iniae、S.difficilis和S.agalactiae代表菌株构建的系统发育进化树显示,所得菌株与S.iniae代表菌株组成同一进化分支,与S.agalactiae代表菌株组成的另一进化分支距离较近(95.5%),而与S.difficilis代表菌株组成的进化分支距离较远(92.3%).上述研究证实,本试验从发病罗非鱼脑组织分离到的致病性链球菌为海豚链球菌.

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来源
《水产学报》 |2007年第5期|618-623|共6页
作者
甘西; 陈明; 余晓丽; 李莉萍; 陈汉忠; 徐增辉; 雷爱莹; 梁万文; 黄维义;
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作者单位

广西水产研究所,广西,南宁,530021;

广西水产研究所,广西,南宁,530021;

广西水产研究所,广西,南宁,530021;

广西水产研究所,广西,南宁,530021;

广西大学动物科学技术学院,广西,南宁,530005;

广西大学动物科学技术学院,广西,南宁,530005;

广西水产研究所,广西,南宁,530021;

广西水产研究所,广西,南宁,530021;

广西大学动物科学技术学院,广西,南宁,530005;

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正文语种 chi
中图分类水产生物学;
关键词
罗非鱼; 海豚链球菌; 16SrRNA; 克隆; 系统发育进化树;

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