3种鲳属鱼类线粒体COI基因序列变异及系统进化

张凤英; 马凌波; 施兆鸿; 马春艳

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对采自东海的银鲳(Pampus argenteus)、翎鲳(P.punctatissimus)和中国鲳(P.chinenMs)3种鲳属鱼类的线粒体COI基因序列片段进行扩增和序列测定,得到603 bp的基因片段,编码201个氨基酸,碱基T、C、A、G平均含量分别为34.2%、22.3%、25.9%和17.6%.所得序列共定义12个单倍型,中国鲳只有1个单倍型,银鲳3个单倍型,翎鲳8个单倍型,在这12个单倍型中共检测到109个变异位点.3种鲳密码子的使用均存在明显的偏向性,且同义密码子使用偏向性高度一致.银鲳和中国鲳的遗传距离最大(0.165～0.168),与翎鲳的遗传距离次之(0.151～0.162),翎鲳和中国鲳的遗传距离最小(0.058～0.065).由进化树可知,翎鲳和中国鲳的进化关系最近,它们与银鲳的进化关系较远,银鲳是最早形成的种.分子水平自然选择的检验结果表明,自然选择在银鲳和翎鲳线粒体COI基冈差异形成过程中起一定的作用.本研究从分子水平研究中国东海海域鲳属鱼类的分类、遗传关系和系统进化,以其了解鲳属鱼类以及与鲳科之间的亲缘关系,又为鲳属鱼类保护生物学和系统进化提供分子生物学依据.[中国水产科学,2008,15(3):392-399]

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来源
《中国水产科学》 |2008年第3期|392-399|共8页
作者
张凤英; 马凌波; 施兆鸿; 马春艳;
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作者单位

中国水产科学研究院东海水产研究所,农业部海洋与河口渔业重点开放实验室,上海,200090;

华东师范大学生命科学学院,上海,200063;

中国水产科学研究院东海水产研究所,农业部海洋与河口渔业重点开放实验室,上海,200090;

中国水产科学研究院东海水产研究所,农业部海洋与河口渔业重点开放实验室,上海,200090;

中国水产科学研究院东海水产研究所,农业部海洋与河口渔业重点开放实验室,上海,200090;

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正文语种 chi
中图分类鲈形目;
关键词
鲳属; 线粒体COI基因; 序列变异; 系统进化; 自然选择;

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