• 主题
高级搜索  >
历史搜索 清空历史
首页> 中文期刊> 《广东海洋大学学报》 >5种虾虎鱼类线粒体COI基因序列变异及系统进化

5种虾虎鱼类线粒体COI基因序列变异及系统进化

         
页面导航
  • 摘要
  • 著录项
  • 相似文献
  • 相关主题

摘要

获得雷州半岛红树林海区5种虾虎鱼稚幼鱼的45条线粒体COI基因序列，其T、C、A、G碱基平均含量分别为29.9%、28.4%、23.9%、17.8%。45条序列共定义23个单倍型，其中检测到变异位点184个，双带缟虾虎鱼（Tridentiger bifasciatus）单倍型比例最高（80.0%）,湖栖鳍虾虎鱼（Gobiopterus lacustris）单倍型比例最低（18.2%）。Kimura 2-parameter遗传距离显示，种间遗传距离为0.1376~0.2635，种内遗传距离为0.0000~0.0208。NJ进化树及ML进化树均表明，聚为5大支系的虾虎鱼类中，阿部氏鲻虾虎鱼（Mugilogobius abei）与诸氏鲻虾虎鱼（M. chulae）亲缘关系最近，湖栖鳍虾虎鱼与其他4种虾虎鱼的亲缘关系稍远。基于群体内等位基因频率分布的中性检验结果表明，双带缟虾虎鱼（Tridentiger bifasciatus）、小口拟虾虎鱼（Pseudogobius masago）、阿部氏鲻虾虎鱼、诸氏鲻虾虎鱼4个群体存在大量低频等位基因位点，而湖栖鳍虾虎鱼群体以中等频率等位基因为主。%45 mitochondrialCOI gene sequences offive kinds of goby juvenilesfrom Mangroves of Leizhou region were obtained,andtheaverage content ofT, C,A, Gwere29.9%, 28.4%, 23.9%, 17.8%, respectively.A total of23 haplotypes were found with 184 variable nucleotide positions,and the haplotype proportionofTridentiger bifasciatuswas thehighest(80.0%), and that ofGobiopterus lacustris was thelowest(18.2%).The inter- and intra-specific genetic distances (Kimura two-parameter, K2P) ranged from 0.1376 to 0.2635, and0.0000 to 0.0208, respectively.Based onNeighbor-Joining and Maximum Likelihood phylogenetic tree,among thegobiesclustered intofive branches, Mugilogobius abeiandM. chulaeare in theclosest relationship,while the relationship between Gobiopterus lacustris and the other fourpopulations is a little far.The neutrality tests indicated thatG. lacustriswasdominated by moderate-frequency allelic loci, while there were a large number of low-frequency allelic loci withinthe other fourpopulations.

著录项

  • 来源
    《广东海洋大学学报》 |2016年第1期|7-12|共6页
  • 作者

    廖健; 张顺; 龙水生; 黄承勤; 郭昱嵩; 王中铎; 刘楚吾;

  • 作者单位

    广东海洋大学水产学院南海水产经济动物增养殖广东普通高校重点实验室;

    广东湛江 524025;

    广东海洋大学水产学院南海水产经济动物增养殖广东普通高校重点实验室;

    广东湛江 524025;

    广东海洋大学水产学院南海水产经济动物增养殖广东普通高校重点实验室;

    广东湛江 524025;

    广东海洋大学水产学院南海水产经济动物增养殖广东普通高校重点实验室;

    广东湛江 524025;

    广东海洋大学水产学院南海水产经济动物增养殖广东普通高校重点实验室;

    广东湛江 524025;

    广东海洋大学水产学院南海水产经济动物增养殖广东普通高校重点实验室;

    广东湛江 524025;

    广东海洋大学水产学院南海水产经济动物增养殖广东普通高校重点实验室;

    广东湛江 524025;

  • 原文格式 PDF
  • 正文语种 chi
  • 中图分类 基因的结构和突变的分子原理;
  • 关键词

    虾虎鱼; 线粒体; COI基因; 系统进化;

相似文献

  • 中文文献
  • 外文文献
  • 专利
获取原文

客服邮箱：kefu@zhangqiaokeyan.com

京公网安备：11010802029741号 ICP备案号：京ICP备15016152号-6 六维联合信息科技 (北京) 有限公司©版权所有

  • 客服微信

  • 服务号