杨梅侧生器官边界域基因组鉴定及进化分析

梁健翔; 吴进樟; 张尧; 曹世江

首页> 中文期刊> 《森林与环境学报》 >杨梅侧生器官边界域基因组鉴定及进化分析

杨梅侧生器官边界域基因组鉴定及进化分析

开具论文收录证明 >>

期刊封面封底目录下载 >>

文献代查 >>

页面导航

摘要
著录项
相似文献
相关主题

摘要

为探究杨梅侧生器官边界域基因(LBD)在杨梅全基因组中的数量和结构,利用杨梅最新基因组的数据,结合生物信息学的方法对基因蛋白进行结构、系统进化和共线性分析,对杨梅LBD基因家族进行了鉴定,并分析其分子质量和等电点,为今后研究LBD基因家族在杨梅成长过程和逆境调节中的详细功能奠定基础。结果表明,从杨梅基因组中共鉴定出33个杨梅LBD(MrLBD)基因,根据染色体分布对其进行重命名。根据其LBD结构域和系统进化树分析的特征,杨梅LBD家族基因分为ClassⅠ和ClassⅡ两类,各有28个和5个LBD基因。杨梅LBD家族基因的结构并不复杂,其中内含子总数不超过2。在对保守域的研究中,通过对LBD基因进行亚细胞定位、三级结构的同源建模和种内与种间共线性分析,发现同一组的基因往往具有相似的外显子-内含子、基序和蛋白质结构。

著录项

来源
《森林与环境学报》 |2021年第2期|P.172-179|共8页
作者
梁健翔; 吴进樟; 张尧; 曹世江;
展开▼
作者单位

福建农林大学林学院福建福州350002;

福建农林大学林学院福建福州350002;

福建农林大学林学院福建福州350002;

福建农林大学林学院福建福州350002;

展开▼
原文格式 PDF
正文语种 chi
中图分类农业植物学;
关键词
杨梅; 侧生器官边界域基因组; 系统进化分析; 转录因子; 生物信息学;

相似文献

中文文献
外文文献
专利

1. 杨梅侧生器官边界域基因组鉴定及进化分析 [J] . 梁健翔 ,吴进樟 ,张尧 . 福建林学院学报 . 2021,第002期
2. 传染性造血器官坏死病毒Sn1203株全基因组序列及系统进化分析 [J] . 赵景壮 ,徐黎明 ,任广明 . 水产学杂志 . 2020,第002期
3. 小麦KUP/HAK/KT基因家族的全基因组鉴定、系统进化和表达模式分析 [J] . 吴胜男 ,杨媛 ,李英壮 . 西北农业学报 . 2021,第003期
4. 南瓜SWEET蛋白家族的全基因组鉴定与进化分析 [J] . 申长卫 ,袁敬平 . 广西植物 . 2021,第001期
5. 黄藤Dof家族的全基因组鉴定及系统进化分析 [J] . 张丹丹 ,杨瑶君 ,江纳 . 西南林业大学学报 . 2021,第006期
6. 基于系统基因组学分析揭示早期陆生植物的复杂网状进化关系 [C] . Jiangping Shu ,舒江平 ,Li Liu . 2016年自然杂交与生物多样性学术研讨会 . -1
7. 玉米侧生器官分化基因ZmLBD16转化拟南芥的功能分析 [A] . 任杨柳 . 2017

杨梅侧生器官边界域基因组鉴定及进化分析

摘要

著录项

相似文献

相关主题

期刊订阅