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中国人丙型肝炎病毒2a型基因组C区基因cDNA的克隆及序列分析

         

摘要

目的:测定陕西地区丙型肝炎病毒的C区基因序列,为进一步研究HCV的流行病学和开展HCV的诊治打下基础.方法:自行设计合成了两条正向引物和两条反向引物,用反转录PCR(RTPCR)法从陕西地区1例NANB型肝炎患者血清中扩增出436bp的片段,将此片段克隆于PGEM7Zf(+)中用全自动序列分析仪测序.结果:测得436bp的核苷酸序列,将所得核苷酸序列及由它们所编码的相应氨基酸序列与HCVJ6,HCVJ8,HCVHebei,HCVHunan,HCV1比较,显示所分离HCV在核苷酸水平上与以上分离株的同源性分别为957%,872%,839%,839%和827%;在氨基酸水平上的同源性分别为977%,947%,908%,901%和901%.

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