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首页> 中文期刊> 《福建农林大学学报（自然科学版）》 >番茄黄化曲叶病毒辽宁葫芦岛分离物的检测和序列分析

番茄黄化曲叶病毒辽宁葫芦岛分离物的检测和序列分析

         
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摘要

采用已报道的菜豆金色花叶病毒属的通用引物PA/PB，从辽宁葫芦岛地区的3份番茄样品中扩增到Begomoviruses的保守区域，获得3个长度约500 bp的克隆序列，同源性为99.58％.DNA-A全基因组序列分析结果显示，3份样品DNA-A全长均为2781 bp(分别命名为LNhud1、LNhud2和LNhud3分离物)，具有典型双生病毒结构，与番茄黄化曲叶病毒(TYLCV)山东分离物( TYLCV-[ CN：SD：SDWF-L7：12]，KC999850)的核苷酸同源性最高(99.6％).根据双生病毒分类标准，认为LNhud1、LNhud2和LNhud3是TYLCV的辽宁分离物.系统关系树表明，这3个分离物属于TYLCV-Isreal株系.%Universal degenerate primers PA/PB were used to detect Begomoviruses from 3 types of tomato plants showing leaf curl-ing symptoms in Huludao City, Liaoning Province, China. An approximately 500 bp fragments were amplified from each source of samples, and 99.58% sequence identity among partial DNA-A fragments confirmed that all three samples were infected by the same virus. Subsequent complete genome sequence analysis showed that DNA-A full length of all three isolates was 2 781 bp and were in the same genomic structure with begomoviral DNA-A. Three isolates were tentatively named LNhud1, LNhud2 and LNhud3, respec-tively. Basing on 99.6% nucleotide sequence identity, three isolates were most closely related to isolate of Tomato yellow leaf curl vi-rus ( TYLCV-[ CN:SD:SDWF-L7:12] , KC999850) from Shandong Province of China. Referring to demarcation criteria for identif-ying begomovirus species, LNhud1, LNhud2 and LNhud3 were considered as isolates of TYLCV and belonged to TYLCV-Isreal strain according to phylogenic analysis.

著录项

  • 来源
    《福建农林大学学报（自然科学版）》 |2016年第4期|376-380|共5页
  • 作者

    杨彩霞; 张帅宗; 孙蓬蓬; 高雅; 汪绪花; 王喆;

  • 作者单位

    沈阳大学生命科学与工程学院/辽宁省城市有害生物治理与生态安全重点实验室;

    辽宁 沈阳110044;

    沈阳大学生命科学与工程学院/辽宁省城市有害生物治理与生态安全重点实验室;

    辽宁 沈阳110044;

    沈阳大学生命科学与工程学院/辽宁省城市有害生物治理与生态安全重点实验室;

    辽宁 沈阳110044;

    沈阳大学生命科学与工程学院/辽宁省城市有害生物治理与生态安全重点实验室;

    辽宁 沈阳110044;

    沈阳大学生命科学与工程学院/辽宁省城市有害生物治理与生态安全重点实验室;

    辽宁 沈阳110044;

    沈阳大学生命科学与工程学院/辽宁省城市有害生物治理与生态安全重点实验室;

    辽宁 沈阳110044;

  • 原文格式 PDF
  • 正文语种 chi
  • 中图分类 植物病理学;
  • 关键词

    菜豆金色花叶病毒属; 番茄黄化曲叶病毒; 辽宁; 序列分析;

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