番鸭源呼肠孤病毒YJL株σNS基因克隆和序列分析

吴异健; 王劭; 黄一帆; 吴宝成

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参考GenBank上公布的禽呼肠孤病毒(ARV)和番鸭呼肠孤病毒(MDRV)σ非结构基因(σNS)序列设计合成一对引物,对番鸭源呼肠孤病毒YJL株σNS全基因进行RT-PCR扩增,克隆到pMD18-T载体中,并对克隆产物进行PCR鉴定和测序;YJL株σNS的编码基因位于S4节段,基因全长1192 bp,其5′端和3′端序列分别为5′-GCTTTT和3′-TATTCATC,具有典型的禽正呼肠孤病毒基因末端碱基序列;σNS基因只有一个有效阅读框(24-1127 bp),编码由367个氨基酸组成的σNS蛋白;σNS蛋白的分子质量约为40.57 ku,等电点(PI)为7.875.YJL株与法国MDRV-89026株σNS基因核苷酸的同源性为77.8%,推导氨基酸的同源性为90.2%;与ARV-S1133株σNS基因的同源性为99.4%,推导氨基酸的同源性为99.5%;系统进化树分析表明,YJL株σNS基因和蛋白与S1133株的亲缘关系更近,处在ARV分支上.可见,番鸭源呼肠孤病毒YJL株属于ARV,同时也表明我国发病番鸭群中存在不同基因群的呼肠孤病毒感染.

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来源
《福建农林大学学报（自然科学版）》 |2010年第5期|495-501|共7页
作者
吴异健; 王劭; 黄一帆; 吴宝成;
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作者单位

福建农林大学动物科学学院;

福建农林大学动物保健研究所;

福建;

福州;

350002;

福建农林大学动物科学学院;

福建农林大学动物科学学院;

福建农林大学动物保健研究所;

福建;

福州;

350002;

福建农林大学动物科学学院;

福建农林大学动物保健研究所;

福建;

福州;

350002;

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原文格式 PDF
正文语种 chi
中图分类双股RNA病毒;
关键词
禽(番鸭)呼肠孤病毒; σNS基因; 克隆; 序列分析;

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