基于转录组学的巨菌草内生链霉菌拮抗玉蜀黍平脐蠕孢的分子机理

黄在兴; 宋昭昭; 梅兰; 李曼; 刘朋虎; 苏德伟; 林占熺; 鲁国东

首页> 中文期刊> 《福建农林大学学报（自然科学版）》 >基于转录组学的巨菌草内生链霉菌拮抗玉蜀黍平脐蠕孢的分子机理

基于转录组学的巨菌草内生链霉菌拮抗玉蜀黍平脐蠕孢的分子机理

开具论文收录证明 >>

期刊封面封底目录下载 >>

文献代查 >>

页面导航

摘要
著录项
相似文献
相关主题

摘要

通过Illumina Hiseq4000高通量测序平台,采用PE150测序策略研究了玉蜀黍平脐蠕孢在链霉菌发酵液胁迫下(S组)的转录组变化,共得到128613786个clean reads,筛选出4559个差异基因.与无发酵液的对照组相比,S组中有2283个基因表达上调,2276个基因表达下调;从中挑选出表达量差异最大的22个基因作为内生链霉菌调控拮抗的拟关键基因,这些基因多涉及氨基酸合成和代谢以及信号转导途径,说明链霉菌发酵液对玉蜀黍平脐蠕孢的氨基酸生物合成和MAPK信号通路相关基因的影响显著;采用实时荧光定量PCR验证其中5个基因的表达量,其趋势与转录组分析结果基本一致.

著录项

来源
《福建农林大学学报（自然科学版）》 |2021年第5期|686-693|共8页
作者
黄在兴; 宋昭昭; 梅兰; 李曼; 刘朋虎; 苏德伟; 林占熺; 鲁国东;
展开▼
作者单位

福建农林大学国家菌草工程技术研究中心;

福建农林大学国家菌草工程技术研究中心;

福建农林大学国家菌草工程技术研究中心;

福建农林大学国家菌草工程技术研究中心;

福建农林大学国家菌草工程技术研究中心;

福建农林大学国家菌草工程技术研究中心;

福建农林大学国家菌草工程技术研究中心;

福建农林大学国家菌草工程技术研究中心;

福建农林大学植物保护学院福建福州350002;

展开▼
原文格式 PDF
正文语种 chi
中图分类土壤-植物系统;
关键词
生物防治; RNA-seq; 高通量测序; 差异基因;

相似文献

中文文献
外文文献
专利

1. 玉蜀黍平脐蠕孢拮抗细菌YB01的鉴定及拮抗作用 [J] . 韩梅 ,彭帅 ,依艳丽 . 植物保护 . 2011,第005期
2. 内脐蠕孢属,平脐蠕孢属和凸脐蠕孢属的分类鉴定 [J] . 文景艺 ,陆家云 . 东北农学院学报 . 1991,第002期
3. 内脐蠕孢属、平脐蠕孢属和凸脐蠕孢属的研究 [J] . 彭金火 ,陆家云 . 南京农业大学学报 . 1989,第4期
4. 麦根腐平脐蠕孢和薏苡平脐蠕孢防治稻田稗草的生物活性和安全性 [J] . 耿锐梅 ,傅扬 ,张文明 . 中国水稻科学 . 2008,第003期
5. 不同致病性的麦根腐平脐蠕孢菌代谢组学分析 [J] . 张琳 ,孟亚雄 ,杨轲 . 山西农业科学 . 2021,第012期
6. 甘蔗平脐蠕孢叶斑病研究初报 [C] . LIN Shan-hai ,林善海 ,HUANG Cheng-hua . 2012全国甘蔗植保技术研讨会 . 2012
7. 中国平脐蠕孢属和弯孢属真菌分子系统学研究 [A] . 郭玉杰 . 2016

基于转录组学的巨菌草内生链霉菌拮抗玉蜀黍平脐蠕孢的分子机理

摘要

著录项

相似文献

相关主题

期刊订阅