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粤西镇海湾近江牡蛎线粒体16S rRNA基因序列变异分析

         

摘要

采用聚合酶链式反应(PCR)技术对粤西镇海湾水域的近江牡蛎Crassostrea rivularis (Gould)群体27个个体的线粒体DNA16S rRNA基因序列片段进行扩增,获得大约500 bp的扩增产物.PCR产物经纯化后进行序列测定,经Clustal X同源排序,除去引物及部分端部序列,得到414 bp的核苷酸片段.27个个体共检测到2个变异位点,均为颠换位点,没发现碱基位点插入、缺失及转换位点,共3种单倍型,每个单倍型只有一个碱基的差异.运用DNASP软件计算得该群体的核苷酸多样性和平均核苷酸差异数分别为0.000 36和0.148 15.此结果提示镇海湾近江牡蛎群体遗传多样性已很低,很有必要从其他分布区引进近江牡蛎亲贝来扩大该种群的遗传多样性.

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