广西钦洲湾养殖牡蛎线粒体16S rRNA基因片段序列变异分析

苏天凤; 江世贵; 朱彩艳; 周发林; 陈丕茂

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广西钦洲湾养殖牡蛎线粒体16S rRNA基因片段序列变异分析

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采用PCR技术对广西钦洲湾水域的养殖牡蛎(传统上被认为是近江牡蛎Crassotrea ariakensis Fujita)群体26个个体的线粒体DNA16S rRNA基因片段序列进行扩增,获得了大约500 bp的扩增产物.PCR产物经纯化后进行序列测定,经同源排序,得到415 bp可供分析的核苷酸片段.26个个体中共检测到18个变异位点,包括1个碱基插入/缺失、11个转换位点及6个颠换位点.共有6种单倍型,这6种单倍型又分为2大类单倍型.运用MEGA软件计算出不同个体间的遗传距离,并构建了UPGMA和NJ系统树.26个个体聚成明显的2支,一支有19个个体,占73.08%;另一支有7个个体,占26.92%;2支间序列差异为3.54%.据此得出结论:钦洲湾养殖牡蛎应存在两大种群或是2个亚种,其差异是否到了种间的分界限,还需进一步研究证实.

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来源
《中国水产科学》 |2005年第1期|1-4|共4页
作者
苏天凤; 江世贵; 朱彩艳; 周发林; 陈丕茂;
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作者单位

中国水产科学研究院,南海水产研究所,广东,广州,510300;

中国水产科学研究院,南海水产研究所,广东,广州,510300;

中国水产科学研究院,南海水产研究所,广东,广州,510300;

中国水产科学研究院,南海水产研究所,广东,广州,510300;

中国水产科学研究院,南海水产研究所,广东,广州,510300;

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原文格式 PDF
正文语种 chi
中图分类瓣鳃纲（双壳纲、斧足纲）;
关键词
牡蛎; 线粒体DNA; 16S rRNA基因; 种群;

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