马氏珠母贝金黄壳色选育群体植核后差异表达免疫基因筛选

王哲; 王姿曼; 郝瑞娟; 李俊辉; 邓岳文

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马氏珠母贝金黄壳色选育群体植核后差异表达免疫基因筛选

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cqvip:【目的】筛选(Pinctada martensii)金黄壳色选育群体植核后免疫相关基因与代谢通路。【方法】利用转录组对植核前后马氏珠母贝的血细胞进行转录组建库及测序分析。【结果和结论】分别获得61.78×106和62.68×106个高质量转录组数据,且映射到参考基因组的平均映射率分别为70.16%和67.82%。与植核前相比,植核后分别有2 925个和3 097个基因显著上调和下调(差异倍数≥2,校正后P≤0.001),其中包括免疫相关基因凝集素、Toll样受体,热休克蛋白等。对差异基因进行GO分类分析,分为基因的分子功能、细胞组分、生物过程3个大类,并细分为11个子类别,其中结合和催化功能的基因较多。KEGG分类分析差异基因,可将基因参与的KEGG代谢通路分为6个分支,细胞过程、环境信息处理、遗传信息处理、人类疾病(仅限动物)、代谢、有机系统。KEGG富集结果显示,差异表达基因显著富集到免疫相关通路胞质DNA感应途径、白细胞跨内皮迁移等免疫通路。

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来源
《广东海洋大学学报》 |2019年第6期|9-16|共8页
作者
王哲; 王姿曼; 郝瑞娟; 李俊辉; 邓岳文;
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作者单位

广东海洋大学水产学院广东湛江 524088;

广东省珍珠养殖与加工工程技术研究中心广东湛江 524088;

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正文语种 chi
中图分类基因工程（遗传工程）;
关键词
马氏珠母贝; 金黄壳色选育群体; 转录组; 免疫相关基因;

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