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金钱鱼基因组微卫星分布特征分析及多态性标记开发

         

摘要

[目的]研究金钱鱼(Scatophagus argus)全基因组微卫星分布特征,筛选高多态性微卫星(SSR)标记.[方法]利用MISA软件对金钱鱼基因组中微卫星进行筛选并分析分布特征,利用聚丙烯酰胺凝胶电泳和毛细管电泳筛选高多态性位点.[结果与结论]金钱鱼基因组总共挖掘390967个SSR位点,相对丰度为653个/Mb.二碱基重复类型最多(52.64%),微卫星标记整体偏向A+T碱基组合.筛选出23对多态性标记位点,其中7对的等位基因数为4~11,期望杂合度为0.431~0.859,观测杂合度0.417~0.861,多态性含量为0.389~0.830.经Bonferroni校正后,5个位点符合哈德温伯格平衡,且位点间不存在连锁不平衡现象.

著录项

  • 来源
    《广东海洋大学学报》 |2020年第4期|7-14|共8页
  • 作者单位

    广东省名特优鱼类生殖调控与繁育工程技术研究中心 //广东海洋大学水产学院 广东 湛江 524088;

    广东省名特优鱼类生殖调控与繁育工程技术研究中心 //广东海洋大学水产学院 广东 湛江 524088;

    阳江职业技术学院食品与环境工程系 广东 阳江 529566;

    广东省名特优鱼类生殖调控与繁育工程技术研究中心 //广东海洋大学水产学院 广东 湛江 524088;

    广东省名特优鱼类生殖调控与繁育工程技术研究中心 //广东海洋大学水产学院 广东 湛江 524088;

    广东省名特优鱼类生殖调控与繁育工程技术研究中心 //广东海洋大学水产学院 广东 湛江 524088;

    广东省名特优鱼类生殖调控与繁育工程技术研究中心 //广东海洋大学水产学院 广东 湛江 524088;

    广东省名特优鱼类生殖调控与繁育工程技术研究中心 //广东海洋大学水产学院 广东 湛江 524088;

    广东省名特优鱼类生殖调控与繁育工程技术研究中心 //广东海洋大学水产学院 广东 湛江 524088;

  • 原文格式 PDF
  • 正文语种 chi
  • 中图分类 基因工程(遗传工程);鲈形目;
  • 关键词

    金钱鱼; 基因组survey测序; 微卫星; 标记开发;

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