高粱LOX基因家族全基因组鉴定及表达模式分析

刘梦; 魏玉磊; 丁冬; 赵训超; 罗伟毅; 徐晶宇

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高粱LOX基因家族全基因组鉴定及表达模式分析

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利用生物信息学技术鉴定高粱脂氧合酶(LOX)家族基因,并对其进化关系、基因结构、保守基序、不同组织及低温胁迫下的表达模式等进行分析,以此为高粱LOX基因的功能研究奠定基础.结果表明,共鉴定出11条高粱LOX家族基因,根据其染色体位置命名为SbLOX1—SbLOX11,该家族基因可分为2个亚族(9-LOX、13-LOX)且同一亚族基因结构基本相似.表达分析发现,不同基因家族成员在不同组织部位的表达模式各不相同,SbLOX10和SbLOX9基因在各个组织部位中表达量均较低,SbLOX2—SbLOX5、SbLOX8在各个组织部位中表达量均较高.对低温(4℃)处理下高粱LOX基因转录组数据进行分析发现,耐冷型高粱9-LOX亚族中的SbLOX1、SbLOX3、SbLOX5和13-LOX亚族中的SbLOX4、SbLOX9在大多时间点均呈上调表达,且在冷敏感材料中表达量也较高,推测LOX基因在低温胁迫响应中具有重要作用.

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来源
《河南农业科学》 |2020年第11期|37-44|共8页
作者
刘梦; 魏玉磊; 丁冬; 赵训超; 罗伟毅; 徐晶宇;
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作者单位

黑龙江八一农垦大学农学院 / 黑龙江省现代农业栽培技术与作物种质改良重点实验室 / 黑龙江省秸秆资源化利用工程技术研究中心黑龙江大庆 163319;

黑龙江八一农垦大学农学院 / 黑龙江省现代农业栽培技术与作物种质改良重点实验室 / 黑龙江省秸秆资源化利用工程技术研究中心黑龙江大庆 163319;

黑龙江八一农垦大学农学院 / 黑龙江省现代农业栽培技术与作物种质改良重点实验室 / 黑龙江省秸秆资源化利用工程技术研究中心黑龙江大庆 163319;

黑龙江八一农垦大学农学院 / 黑龙江省现代农业栽培技术与作物种质改良重点实验室 / 黑龙江省秸秆资源化利用工程技术研究中心黑龙江大庆 163319;

黑龙江八一农垦大学农学院 / 黑龙江省现代农业栽培技术与作物种质改良重点实验室 / 黑龙江省秸秆资源化利用工程技术研究中心黑龙江大庆 163319;

黑龙江八一农垦大学农学院 / 黑龙江省现代农业栽培技术与作物种质改良重点实验室 / 黑龙江省秸秆资源化利用工程技术研究中心黑龙江大庆 163319;

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正文语种 chi
中图分类高粱;
关键词
高粱; 脂氧合酶基因家族; 基因结构; 进化关系; 表达模式;

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