对嗜压蛋白氨基酸压力不对称指数的修订

张光亚

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选取嗜压菌最多的4种希瓦氏菌属(Shewanella)微生物共计473对同源蛋白,统计了21 662个氨基酸突变位点,在此基础上计算氨基酸压力不对称指数(PAI),并将其同氨基酸70种理化性质进行相关性分析.结果表明:色氨酸和异亮氨酸的嗜压性能最强,而脯氨酸、甘氨酸和天冬酰胺的嗜压性能最弱,这与之前的报道存在较大差异.此外,70种氨基酸理化性质中有13种同PAI存在较强的相关性,其中仅有氨基酸的无规则倾向因子同PAI呈负相关,表明高的PAI值不易形成卷曲.由于展示的PAI值更适合于处于低温环境下的嗜压微生物,因此对以前的PAI值进行了修正.

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来源
《华侨大学学报：自然科学版》 |2012年第1期|44-50|共7页
作者
张光亚;
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作者单位

华侨大学化工学院;

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正文语种 chi
中图分类微生物生物化学;
关键词
嗜压微生物; 压力不对称指数; 氨基酸; 倾向因子; 适压机制;

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