mRNA序列中回文密度对蛋白质折叠速率的影响

李雪; 李瑞芳; 张培龙; 黄俏; 郭春阳

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mRNA序列中回文密度对蛋白质折叠速率的影响

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建立了一个包括回文结构特征等核苷酸信息的蛋白质折叠数据库,以数据库中每一个蛋白质为研究样本,计算了相应mRNA序列中回文结构的回文密度,分析了回文密度与蛋白质折叠速率之间的相关性.结果证实,对于所有蛋白质,回文密度与蛋白质折叠速率呈负相关;进一步研究发现,对蛋白质折叠进程真正起阻碍作用的是那些被几个回文结构重复使用的碱基,而且对于不同二级结构类蛋白质以及不同折叠类蛋白质,回文密度与蛋白质折叠速率的相关性有很大的差异.

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来源
《内蒙古师范大学学报：自然科学版》 |2016年第3期|333-337|共5页
作者
李雪; 李瑞芳; 张培龙; 黄俏; 郭春阳;
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作者单位

内蒙古师范大学物理与电子信息学院;

内蒙古自治区人民医院信息中心;

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正文语种 chi
中图分类理论生物物理学;
关键词
mRNA序列; 蛋白质折叠速率; 回文结构; 回文密度;

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