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基于生物信息学预测分析C/EBPα靶基因及其在急性髓系白血病中的潜在机制

         

摘要

急性髓系白血病(acute myeloid leukemia,AML)属于造血系统克隆性恶性疾病。为了寻求AML临床治疗的潜在靶点,预测急性髓系白血病相关转录因子C/EBPα在急性髓系白血病中的发病机制,利用基因表达数据库(gene expression omnibus,GEO)筛选出敲除Cebpa基因的实验组与正常造血干细胞间的差异表达基因,并对其进行基因本体(GO)功能分析、京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路分析。结果显示:在86个差异表达基因中,共有44个上调基因和42个下调基因;差异基因具有参与RNA聚合酶Ⅱ启动子转录的正调控、造血、基因表达的正向调控等功能,并且参与JAK-STAT信号通路、MAPK信号通路、PI3K-Akt信号通路的传导;而C/EBPα也与信号通路中的蛋白具有互作关系。由此预测异常表达的C/EBPα可能通过影响信号通路来干预急性髓系白血病的发病与预后。

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