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群体细胞Hi-C文库的建立及其质量控制

         

摘要

目的验证常规Hi-C(highest-throughput chromosome conformation capture)建立文库的方法,并留意其中的关键步骤和注意事项,为以后的研究者提供参考依据。方法收集染色体核型异常者和正常者各2例的外周血标本,提取单个核细胞,经甲醛交联后,按照常规Hi.c方法,构建Hi-C文库,并对实验过程进行浓度检测、交联效果检测、染色质完整性检测、文库质量检测等质量控制。结果构建了4个Hi-C文库,对常规Hi-C流程的各个质量质控点的检测结果均符合Hi-C建库的要求。结论常规Hi-C流程的可重复性是可靠的。

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