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HCVIRES特异性抑制性RNA二级结构模拟及自剪切转录载体构建

         

摘要

目的 :构建可保证HCVIRES特异性抑制性RNA(IRNA)序列完整性的转录载体。 方法 :应用计算机软件模拟IRNA二级结构 ;体外化学合成IRNA及其互补体的cDNA ,以AatⅡ和XbaⅠ双酶切后克隆入具自剪切作用的顺式核酶载体pGEMRz中 ;应用酶切方法、PCR和测序法对重组载体进行三重鉴定 ;最后对重组体进行体外转录。 结果 :计算机模拟发现HCVIRES特异性IRNA二级结构包括两个环、一个茎状结构和一个膨出 ,在其序列两端加3~ 5个碱基不会改变其二级结构 ,而缺失 3~ 5个碱基却会明显改变其结构。经三重鉴定证实 ,目的序列被正确地克隆入质粒pGEMRz,并经体外转录得到约 70个碱基大小的IRNA。 结论 :本研究构建转录载体pGRz IRNA可保证IRNA序列的完整性。

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