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替莫唑胺对胶质母细胞瘤基因表达谱影响的研究

         

摘要

目的:探索替莫唑胺(TMZ)对胶质母细胞瘤裸鼠移植瘤模型基因表达谱的影响。方法:从基因表达公共数据库(GEO)下载表达谱数据集GSE47809,采用GEO2R在线工具筛选不同实验条件组别的差异表达基因(DEGs),然后对差异基因分别进行基因本体(GO)功能富集分析、通路富集分析、基因共表达网络分析和通路互作网络分析。结果:从TMZ处理组和未处理组脑肿瘤组织之间共鉴定出1936个差异基因,其中1031个上调表达基因,905个下调表达基因。GO富集分析表明,DEGs发挥的分子功能集中在蛋白结合、ATP结合、蛋白激酶活性、细胞骨架蛋白结合、转录因子活性等,主要参与转录调控、信号转导、轴突导向、细胞凋亡调控、细胞黏附、细胞周期停滞和DNA复制等生物学过程。通路富集分析发现,DEGs显著富集的通路包括肿瘤通路、磷脂酰肌醇3-激酶(PI3K)-蛋白激酶B(AKT)信号通路、丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)信号通路、细胞骨架调节、细胞周期、Hippo信号通路、P53通路等。网络分析挖掘出的核心基因有PI3KCD、AKT3、表皮生长因子受体(EGFR)、蛋白磷酸酶1催化亚基β(PPP1CB)、磷脂酰肌醇5-激酶1α(PIP5K1A)、辅肌动蛋白α1(ACTN1),核心通路包括MAPK信号通路、细胞凋亡、肿瘤通路和细胞周期等。结论:替莫唑胺引起胶质母细胞瘤基因转录谱发生明显改变,主要涉及细胞周期阻滞、凋亡诱导、细胞侵袭和转移等生物过程和信号通路,为深入研究TMZ细胞毒性机制和耐药机制提供参考。

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