16S rRNA、16S-23S rRNA基因测序分析检测主要血流感染病原菌比较

金中淦; 葛平; 徐蓉; 陈蓉; 宣瑛; 刘学杰; 王庆忠

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目的比较细菌16S rRNA、16S-23S rRNA基因测序分析在血流感染病原菌检测中的作用.方法提取临床上血流感染常见的金黄色葡萄菌、表皮葡萄球菌、大肠埃希菌、粪肠球菌、肺炎链球菌、铜绿假单胞菌、阴沟肠杆菌、鲍曼不动杆菌、洛菲不动杆菌、肺炎克雷伯杆菌、化脓性链球菌、奇异变形杆菌、潘尼变形杆菌、屎肠球菌、粘质沙雷菌、宋内志贺菌、产气肠杆菌、小肠结肠炎耶尔森菌、腐生葡萄球菌基因组DNA,运用16S rRNA、16S-23S rRNA基因进行PCR扩增.扩增产物经测序后在美国国家生物技术中心( NCBI)上进行比对分析,确定菌种.结果在所分析的19种临床血流感染常见细菌中,16S rRNA基因测序分析可将除粘质沙雷菌外的细菌鉴定到种的水平,但无法完全区分近缘种属；16S-23SrRNA成功鉴定17种细菌,除大肠埃希菌、宋内志贺菌外所有细菌均成功鉴定到单一种的水平.结论 16S-23S rRNA基因可作为血流感染细菌检测较好的分子靶标.

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来源
《分子诊断与治疗杂志》 |2012年第3期|181-185|共5页
作者
金中淦; 葛平; 徐蓉; 陈蓉; 宣瑛; 刘学杰; 王庆忠;
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作者单位

上海市临床检验中心,上海,200126;

上海市临床检验中心,上海,200126;

上海市临床检验中心,上海,200126;

上海市临床检验中心,上海,200126;

上海市临床检验中心,上海,200126;

上海市临床检验中心,上海,200126;

上海市临床检验中心,上海,200126;

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正文语种 chi
中图分类
关键词
16SrRNA; 16S-23SrRNA;

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