骨关节炎患者膝关节滑膜组织的基因表达谱分析

谌虹焰; 张明媚; 陈杏; 王涛; 谢庆云; 魏萌

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骨关节炎患者膝关节滑膜组织的基因表达谱分析

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目的:分析骨关节炎患者膝关节滑膜组织的基因表达谱.方法:从公共基因芯片数据库选取芯片数据,利用GEO2R筛选骨关节炎患者滑膜组织和正常滑膜组织的差异表达基因;对筛选出的基因进行GO功能和KEEG通路富集分析,利用STRING数据库及Cytoscape软件构建蛋白间相互作用网络,筛选关键基因.结果:纳入数据库中两组基因芯片数据,共筛选出131个共同差异表达基因,其中上调基因98个,下调基因33个.GO富集分析提示,差异基因主要在细胞粘附、对成纤维细胞生长因子刺激的反应、细胞内受体信号通路等功能富集.KEGG富集结果显示,差异表达基因参与了丝裂原活化蛋白激酶、低氧诱导因子-1、磷脂酰肌醇3激酶/蛋白激酶B等信号通路.蛋白间相互作用网络提示了10个关键基因.结论:通过对OA基因表达谱分析筛选差异表达基因发现OA的发病机制不仅与细胞增殖、病理性血管生成、炎症刺激等有关,更是多信号通路、多靶点间相互作用的结果,可为进一步研究提供参考.

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来源
《川北医学院学报》 |2021年第4期|425-428|共4页
作者
谌虹焰; 张明媚; 陈杏; 王涛; 谢庆云; 魏萌;
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作者单位

西南交通大学医学院;

西部战区总医院风湿免疫科;

西南交通大学医学院;

西南交通大学医学院;

西部战区总医院风湿免疫科;

西部战区总医院骨科四川成都 610083;

西南交通大学医学院;

西部战区总医院风湿免疫科;

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原文格式 PDF
正文语种 chi
中图分类关节炎;
关键词
骨关节炎; 差异表达基因; 生物信息学; 滑膜;

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