基于云南臭蛙抗菌肽序列分析的药物设计策略

邬晓勇; 孙雁霞; 何钢; 苟兴华; 苟小军

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基于云南臭蛙抗菌肽序列分析的药物设计策略

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通过生物信息学手段分析云南臭蛙抗菌肽的结构与功能,为合成此类抗菌肽和通过基因工程方法生产新药物提供理论依据.通过互联网和计算机软件比较和分析了云南臭蛙抗菌肽的成熟肽序列和二级结构,设计了一个具有抗菌活性的抗菌肽分子.结果表明:成熟肽的正电荷和α螺旋结构与抗菌肽的活性密切相关.根据分析结果,设计了一条抗菌肽序列:GL(A/V/I)AANFLPK(T)AF(L)CXXXK(R)KC,此抗菌肽分子可能具有较强的抗菌活性.表明正电荷是影响抗菌肽与致病菌细胞膜结合的关键,而α螺旋的两亲性结构则在抗菌肽插入脂质双分子层中起重要作用.在维持保守氨基酸不变的情况下,可在适当位置改变或置换一些氨基酸,对天然抗菌肽进行基因改造或人工合成此类抗菌肽,不失为开发新药物的一条捷径.

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来源
《西北师范大学学报：自然科学版》 |2011年第4期|81-86|共6页
作者
邬晓勇; 孙雁霞; 何钢; 苟兴华; 苟小军;
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作者单位

成都大学药食同源植物资源开发重点实验室;

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原文格式 PDF
正文语种 chi
中图分类生物小分子的结构和功能;
关键词
云南臭蛙; 抗菌肽; 序列分析; 药物设计;

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