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首页> 中文期刊> 《上海交通大学学报：农业科学版》 >陕西省部分地区猪瘟流行毒株与疫苗毒株E_2基因主要抗原区序列变异分析

陕西省部分地区猪瘟流行毒株与疫苗毒株E_2基因主要抗原区序列变异分析

         
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研究陕西省猪瘟病毒E2基因主要抗原区变异情况,为猪瘟防控提供依据。用巢式PCR方法对猪瘟疫苗和采自陕西省部分地区的疑似猪瘟病料进行E2基因主要抗原区扩增并测序,将测序结果与HCLV疫苗株和Shimen株E2基因进行序列比对分析。结果表明,23株流行毒株之间的核苷酸同源性在86.0%～100%,氨基酸同源性在87.8%～100%;与HCLV株相比,核苷酸同源性在77.2%～81.2%,氨基酸同源性为78.9%～88.9%;与经典强毒Shimen株核苷酸同源性为77.2%～80.9%,氨基酸同源性为80.0%～90.0%。2株疫苗毒E2基因和HCLV株相比较,核苷酸同源性为93.4%,氨基酸同源性为90.0%;和Shimen株核苷酸同源性为94.1%,氨基酸同源性为92.2%。疫苗和经典HCLV株E2主要抗原区相比,在所测定的91个氨基酸位点中有9个位点发生了变异,流行毒株相对于HCLV株有12个氨基酸位点发生了变异。流行毒株E2基因主要抗原区发生了较明显的变异,疫苗E2基因主要抗原区和HCLV株相比发生了较为明显的变异。疫苗和流行毒株只有3个变异位点相同,提示疫苗和流行毒的变异趋势不一致。

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