基于类别保留投影的基因表达数据降维方法

王文俊; 张军英; 杨利英

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基于类别保留投影的基因表达数据降维方法

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针对基因表达数据的高维小样本问题,提出一种新的线性降维方法。该方法采用保局投影,结合样本的类别信息,将基因表达数据投影到特征子空间。与主分量分析方法寻找最大方差方向不同,类别保留投影方法旨在寻找能够反映样本类别结构的特征子空间。采用该方法进行数据降维的同时能使样本按照类别属性进行聚类。对真实的基因表达数据进行了降维可视化和k均值聚类分析,并与主分量分析方法进行了实验比较,结果表明,类别保留投影方法在实现降维的同时能更好地识别样本的类别特征,从而可视化效果相比主分量分析要好得多,且能得到较好的聚类效果。

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来源
《工程科学与技术》 |2009年第6期|153-157|共5页
作者
王文俊; 张军英; 杨利英;
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作者单位

西安电子科技大学计算机学院;

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原文格式 PDF
正文语种 chi
中图分类 TP391.41;
关键词
基因表达数据; 类别保留投影; 可视化; 聚类分析;

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